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蛋白质折叠过程中自回避搜索的算法研究

王仲君

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文章导航 > 交通信息与安全  > 2005 >  23(4): 43-46
王仲君. 蛋白质折叠过程中自回避搜索的算法研究[J]. 交通信息与安全, 2005, 23(4): 43-46. doi: 10.3963/j.issn.1674-4861.2005.04.012
引用本文: 王仲君. 蛋白质折叠过程中自回避搜索的算法研究[J]. 交通信息与安全, 2005, 23(4): 43-46. doi: 10.3963/j.issn.1674-4861.2005.04.012
shu
Wang Zhongjun. Algorithm of Self-avoiding Search in the Process of Protein Folding[J]. Journal of Transport Information and Safety, 2005, 23(4): 43-46. doi: 10.3963/j.issn.1674-4861.2005.04.012
Citation: Wang Zhongjun. Algorithm of Self-avoiding Search in the Process of Protein Folding[J]. Journal of Transport Information and Safety, 2005, 23(4): 43-46. doi: 10.3963/j.issn.1674-4861.2005.04.012
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蛋白质折叠过程中自回避搜索的算法研究

doi: 10.3963/j.issn.1674-4861.2005.04.012

  • 武汉理工大学,武汉,430063

基金项目: 

国家自然科学基金

详细信息

  • 中图分类号: Q51

Algorithm of Self-avoiding Search in the Process of Protein Folding

    摘要
  • 摘要: 蛋白质折叠是一个复杂的演化过程.目前广泛采用HP格子模型,可以使分子内部连续的结构空间离散化,减少分子内部的自由度,从而较有效地研究蛋白质的折叠机理.在格子模型中,自回避路径的确定是搜索折叠构象的关键.文章在基于二维HP格子模型基础上,提出了一种简捷快速的自回避路径搜索算法,并在计算机上进行实例检测及模拟,产生效果较好的蛋白质折叠构象.但对于长序列,自回避路径折叠搜索计算时间将呈指数增长.为了更真实地模拟蛋白质折叠过程,文章进一步探讨了建立并行HP格子模型思路,对较长序列的折叠,其折叠过程不会因为序列长度的增加而快速增大模拟的复杂度,且符合生命的演化规律.

     

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出版历程
  • 刊出日期:  2005-08-28

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